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香菇根瘤病是一种生理性病害。主要原因是出菇后气温低，蒸发少，菌丝活力弱，吸水能力差，出菇慢，喷水过多，相对湿度高，或突然气候变化刺激，通风不良，酸性堆肥，喷药过多葡萄糖过多（肥料破坏）和其他因素。
预防措施：根据蘑菇子实体和菌丝的生长情况以及天气情况来浇水。低温时注意避免喷水和通风。覆盖土的含水量一般应在18%22%之间。如果培养物呈酸性，可喷洒3%的石灰水澄清液缓解。
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